Die Aufgabe der Bioanalytik ist die Unterstützung der Projektgruppen in allen Fragen bezüglich der qualitativen und quantitativen Analyse auf molekularer Ebene. In Kooperation mit den verschiedenen Projektgruppen werden dabei die benötigten Analyseprotokolle entwickelt, etabliert und die Messungen durchgeführt. Dabei werden viele verschiedene Ebenen der Omics-basierten Wissenschaften genutzt wie Proteomics, Metabolomics und Lipidomics, um einen möglichst umfassenden Überblick über die molekularen Veränderungen zu erhalten, die von unterschiedlichen Erkrankungen, Behandlungen oder anderen internen und externen Stimuli hervorgerufen werden.

Dazu werden vorwiegend Chromatographie-gekoppelte Massenspektrometrie-Verfahren verwendet, die sowohl die gezielte hochsensitive Quantifizierung bekannter Analyten als auch die Identifizierung und Quantifizierung bisher unbekannter Zielmoleküle ermöglichen. Darüber hinaus werden auch Hochdurchsatz-Verfahren für die Bestimmung von Entzündungsfaktoren und biogene Amine etabliert und für die Projektgruppen des Instituts bereitgestellt. Weiterhin wird auch technische Unterstützung z.B. bei der Steuerung und Kontrolle der Expositionsversuche mit freiwilligen Versuchspersonen für die anderen Arbeitsgruppen geleistet.