Leitung Forschungsbereich
Ein großer Teil der Forschung am IfADo wird an Zellkulturen und Tiermodellen durchgeführt. Häufig stellt sich die Frage, wie relevant die so entdeckten Mechanismen für Menschen sind. Um diese Frage besser beantworten zu können, hat die EMF ein klinisches Netzwerk aufgebaut und verfügt über umfassenden Zugang zu menschlichen Gewebebanken. Beispiele der Aktivitäten:
- Blutproben, z. B. von Patient:innen nach Überdosis hepatotoxischer Pharmaka haben zur Entdeckung neuer Mechanismen der Hepatotoxizität geführt (Ghallab et al., 2022).
- Ein besonderer Fokus sind Lebergewebe mit krankheitsrelevanten Informationen, welche gemeinsam mit der Bioanalytik-Gruppe untersucht wurden (Schneider et al., 2021; Mohs et al., 2021; Remetic et al., 2022; Ramisch et al., 2019).
- Isolierte Einzelzellen aus menschlichen Organen, z. B. Leberzellen (Nell et al., 2022).
- Gewebe aus menschlichen Tumoren (Almstedt et al., 2022).
Weiterhin hat die EMF Erfahrung bei der Organisation klinischer Studien (Edlund et al., 2021) und verfügt über Möglichkeiten ärztlicher Eingriffe und Diagnostik.
Referenzen
Almstedt K, Heimes AS, Kappenberg F, Battista MJ, Lehr HA, Krajnak S, Lebrecht A, Gehrmann M, Stewen K, Brenner W, Weikel W, Rahnenführer J, Hengstler JG, Hasenburg A, Schmidt M: Long-term prognostic significance of HER2-low and HER2-zero in node-negative breast cancer. Eur J Cancer 173: 10-19 (2022).Doi: https://doi.org/10.1016/j.ejca.2022.06.012
Edlund K, Madjar K, Lebrecht A, Aktas B, Pilch H, Hoffmann G, Hofmann M, Kolberg HC, Boehm D, Battista MJ, Seehase M, Stewen K, Gebhard S, Cadenas C, Marchan R, Brenner W, Hasenburg A, Koelbl H, Solbach C, Gehrmann M, Tanner B, Weber K, Loibl S, Sachinidis A, Rahnenführer J, Schmidt M, Hengstler JG: Gene expression-based prediction of neoadjuvant chemotherapy response in early breast cancer: results of the prospective multicenter EXPRESSION trial. Clin Cancer Res 27: 2148-2158 (2021). Doi: https://dx.doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-20-2662
Ghallab A, Hassan R, Hofmann U, Friebel A, Hobloss Z, Brackhagen L, Begher-Tibbe B, Myllys M, Reinders J, Overbeck N, Sezgin S, Zühlke S, Seddek AL, Murad W, Brecklinghaus T, Kappenberg F, Rahnenführer J, González D, Goldring C, Copple IM, Marchan R, Longerich T, Vucur M, Luedde T, Urban S, Canbay A, Schreiter T, Trauner M, Akakpo JY, Olyaee M, Curry SC, Sowa JP, Jaeschke H, Hoehme S, Hengstler JG: Interruption of bile acid uptake by hepatocytes after acetaminophen overdose ameliorates hepatotoxicity. J Hepatol 77: 71-83 (2022). Doi: https://doi.org/10.1016/j.jhep.2022.01.020
Mohs A, Otto T, Schneider KM, Peltzer M, Boekschoten M, Holland CH, Hudert CA, Kalveram L, Wiegand S, Saez-Rodriguez J, Longerich T, Hengstler JG, Trautwein C: Hepatocyte-specific NRF2 activation controls fibrogenesis and carcinogenesis in steatohepatitis. J Hepatol 74: 638-648 (2021). Doi: https://dx.doi.org/10.1016/j.jhep.2020.09.037
Nell P, Kattler K, Feuerborn D, Hellwig B, Rieck A, Salhab A, Lepikhov K, Gasparoni G, Thomitzek A, Belgasmi K, Blüthgen N, Morkel M, Küppers-Munther B, Godoy P, Hay DC, Cadenas C, Marchan R, Vartak N, Edlund K, Rahnenführer J, Walter J, Hengstler JG: Identification of an FXR-modulated liver-intestine hybrid state in iPSC-derived hepatocyte-like cells. J Hepatol 77: 1386-1398 (2022). Doi: https://doi.org/10.1016/j.jhep.2022.07.009
Ramisch A, Heinrich V, Glaser LV, Fuchs A, Yang X, Benner P, Schöpflin R, Li N, Kinkley S, Römer-Hillmann A, Longinotto J, Heyne S, Czepukojc B, Kessler SM, Kiemer AK, Cadenas C, Arrigoni L, Gasparoni N, Manke T, Pap T, Pospisilik JA, Hengstler J, Walter J, Meijsing SH, Chung HR, Vingron M: CRUP: a comprehensive framework to predict condition-specific regulatory units. Genome Biol 20(1): 227 (2019) (23 pp). Doi: https://doi.org/10.1186/s13059-019-1860-7
Remetic J, Ghallab A, Hobloss Z, Brackhagen L, Hassan R, Myllys M, Radun R, Mlitz V, Zhu C, Baumgartner M, Schrottmaier WC, Mussbacher M, Timelthaler G, Scharnagl H, Stojakovic T, Assinger A, Fuchs CD, Hengstler JG, Trauner M: Loss of bile salt export pump aggravates lipopolysaccharide-induced liver injury in mice due to impaired hepatic endotoxin clearance. Hepatology 75: 1095-1109 (2022). Doi: https://doi.org/10.1002/hep.32289
Schneider KM, Candels LS, Hov JR, Myllys M, Hassan R, Schneider CV, Wahlström A, Mohs A, Zühlke S, Liao L, Elfers C, Kilic K, Henricsson M, Molinaro A, Hatting M, Zaza A, Drasdo D, Frissen M, Devlin AS, Gálvez EJC, Strowig T, Karlsen TH, Hengstler JG, Marschall HU, Ghallab A, Trautwein C: Gut microbiota depletion exacerbates cholestatic liver injury via loss of FXR signalling. Nat Metab 3 (9):1228-1241 (2021). Doi: https://doi.org/10.1038/s42255-021-00452-1